16年入职但社保第一次入保时间是18年9月，但是只

单位补缴社保但仅交三险存在问题。分析：根据社保法规定，用人单位应为员工缴纳五险，包括养老、医疗、失业、工伤、生育。仅缴纳三险不符合法律规定，侵害了员工的合法权益。提醒：若单位持续不按规定缴纳社保，或拒绝补缴缺失的险种，表明问题比较严重，应及时寻求劳动监察或劳动仲裁等法律途径解决。
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具体操作：1.协商阶段：明确告知单位应缴纳五险的法律规定，要求单位补缴缺失的险种，并保留协商记录。2.投诉阶段：向当地劳动监察部门提交书面投诉，附上劳动合同、社保缴纳记录等证据，详细说明单位未按规定缴纳社保的情况。3.仲裁阶段：若投诉无果，可向劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，提交相关证据，要求单位补缴社保并承担相应法律责任。4.诉讼阶段：若劳动仲裁裁决不满意，可向人民法院提起诉讼，通过司法途径维护自身权益。在整个过程中，务必保留好相关证据，以便在必要时使用。
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处理方式：从法律角度看，针对单位未按规定缴纳社保的问题，常见的处理方式有与单位协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼。选择建议：首先尝试与单位协商，无果后可向劳动监察部门投诉，必要时可申请劳动仲裁或提起诉讼，以维护自身合法权益。